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鴨母王朱一貴可說是內門最出名的人物，清朝時移居來台與五十二義士引發全臺最轟動的反清復明戰爭，並登基為帝，後來因內鬨，最終被清軍擒殺。但朱一貴的英雄形象深植人心，因此內門區民替其修廟建祠，鴨母祠與興安宮及一併規劃。廟埕前可見一口井，是當時朱一貴飲用、養鴨的水井，據說用此井泡茶、烹煮鴨蛋風味特別甘甜、鮮嫩。